Enquanto as guerras clônicas varrem a galáxia, os heróicos Cavaleiros Jedi lutam para manter a ordem e restaurar a paz. Cada vez mais sistemas são atingidos pelas forças do lado negro, enquanto a República Galáctica avança nas trevas sob influência dos Separatistas e seu inextinguível exército.

Anakin Skywalker e sua Padawan, Ahsoka Tano, estão em missão de grande alcance, que os leva a encarar o senhor do mal, Jabba, The Hutt.  Mas o Conde Dookan e seus sinistros agentes, incluindo a nefasta Asajj Ventress, não sossegarão enquanto não detiverem Anakin e Ahsoka.

Enquanto isso, na linha de frente das guerras clônicas, Obi-Wan Kenobi e o Mestre Yoda lideram um grande exército de clones, no bravo esforço para resistir às forças do lado negro.